Protein–RNA interactions for Protein: P04430

IGKV1-16, Immunoglobulin kappa variable 1-16, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-16P04430 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV1-16P04430 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms