Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGAP02671 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGAP02671 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGAP02671 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGAP02671 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGAP02671 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms