Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL5O76039 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms