Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNKO75909 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNKO75909 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNKO75909 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNKO75909 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNKO75909 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms