Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F6O75461 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms