Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPLO60437 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPLO60437 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPLO60437 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPLO60437 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPLO60437 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPLO60437 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPLO60437 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPLO60437 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPLO60437 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPLO60437 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPLO60437 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPLO60437 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms