Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALUO43852 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALUO43852 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALUO43852 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALUO43852 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CALUO43852 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALUO43852 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms