Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGTAO43765 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGTAO43765 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGTAO43765 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGTAO43765 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGTAO43765 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGTAO43765 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGTAO43765 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGTAO43765 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms