Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAB2O43741 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms