Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRC1O43663 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRC1O43663 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRC1O43663 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRC1O43663 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms