Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DENRO43583 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DENRO43583 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DENRO43583 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DENRO43583 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DENRO43583 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DENRO43583 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms