Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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