Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARPC1BO15143 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARPC1BO15143 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms