Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms