Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F3O00716 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F3O00716 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F3O00716 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F3O00716 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F3O00716 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F3O00716 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms