Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms