Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATL2C9JE40 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms