Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF28PB7ZC32 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF28PB7ZC32 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms