Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms