Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00587B1AMM8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms