Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L5A8MUK1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms