Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOBPA7XYQ1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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