Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C4orf47A7E2U8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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