Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DBX1A6NMT0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms