Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC160A6NGH7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms