Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms