Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPV5-201ENST00000265310 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LYPD6-203ENST00000409381 3578 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ACKR1-204ENST00000537147 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PAN2-203ENST00000440411 4576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CAB39L-201ENST00000347776 3361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC183088.1-201ENST00000626622 3398 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRMO-207ENST00000611338 3635 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR47-202ENST00000361054 4115 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NAIP-201ENST00000194097 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PNMA8A-201ENST00000313683 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005358.2-201ENST00000584772 3679 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00661-204ENST00000549354 3340 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FCHSD1-201ENST00000435817 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GOSR2-239ENST00000640608 3871 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ARMC8-217ENST00000481646 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RSPH3-202ENST00000367069 6561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms