Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CTPS2-203ENST00000443824 4319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018647.2-201ENST00000605778 4200 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA4-201ENST00000571252 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH7-201ENST00000339553 3459 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ME1-201ENST00000369705 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCA8-201ENST00000269080 5677 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FLNB-AS1-202ENST00000488720 3709 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AP3B2-215ENST00000620652 3729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF16-209ENST00000611477 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ISX-202ENST00000404699 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EYA1-204ENST00000388741 3404 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 OCLN-201ENST00000355237 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SALL4-201ENST00000217086 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HYDIN-203ENST00000321489 3685 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-225ENST00000626620 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP1A3-209ENST00000602133 3458 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNA2-203ENST00000485317 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP2B3-205ENST00000393842 4064 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF438-205ENST00000436087 3164 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGIS-201ENST00000244043 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL6-201ENST00000341319 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.4 ms