Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CAST-213ENST00000504465 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 TNFRSF10D-201ENST00000312584 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 ASNSD1-201ENST00000260952 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 TRIM16-202ENST00000416464 3184 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRHP20396 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRHP20396 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms