Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC012513.3-201ENST00000623250 2116 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FOXC1Q12948 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FOXC1Q12948 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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