Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RYR3Q15413 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RYR3Q15413 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms