Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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ARL2-SNX15V9GYD0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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