Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms