Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF2Q9Y6D5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF2Q9Y6D5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms