Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF6Q9Y252 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms