Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSEQ9Y251 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSEQ9Y251 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms