Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIGD1AQ9Y241 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms