Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms