Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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