Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED23Q9ULK4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED23Q9ULK4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms