Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN11AQ9UI33 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms