Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPC1L1Q9UHC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms