Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms