Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP35Q9P2H5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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