Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CABP1Q9NZU7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP1Q9NZU7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms