Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms