Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM167BQ9NRX6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM167BQ9NRX6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms