Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.552e-9■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.785e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-219ENST00000461968 747 ntTSL 225.54■■□□□ 1.685e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.535e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-241ENST00000490460 1074 ntTSL 322.6■■□□□ 1.215e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-232ENST00000482633 415 ntTSL 221.88■■□□□ 1.095e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.824e-11■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.724e-11■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.625e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 217.92■□□□□ 0.464e-11■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-223ENST00000466251 485 ntTSL 517.61■□□□□ 0.415e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-240ENST00000489388 1022 ntTSL 216.65■□□□□ 0.265e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.184e-11■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-213ENST00000528509 2999 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-11■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.294e-11■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-239ENST00000489321 731 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.595e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-205ENST00000348787 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.675e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-204ENST00000345491 2220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.695e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-215ENST00000427847 635 ntTSL 310.32□□□□□ -0.765e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-235ENST00000487132 655 ntTSL 59.66□□□□□ -0.865e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-245ENST00000495960 895 ntTSL 59.29□□□□□ -0.925e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-212ENST00000374728 1933 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.955e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-213ENST00000374734 711 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.985e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-231ENST00000479070 939 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.985e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL3-224ENST00000484868 318 ntTSL 38.57□□□□□ -1.044e-8■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.055e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-218ENST00000460270 1416 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.065e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.095e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.15e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-11■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.265e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-222ENST00000464475 453 ntTSL 57.04□□□□□ -1.285e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CREM-246ENST00000496019 563 ntTSL 36.59□□□□□ -1.355e-12■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 192.5
UTP3Q9NQZ2 CYFIP1-206ENST00000613006 544 ntTSL 414.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CYFIP1-209ENST00000619037 575 ntTSL 414.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CYFIP1-204ENST00000611832 582 ntTSL 213.36□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF558-206ENST00000599938 780 ntTSL 530.04■■■□□ 2.49e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.399e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.729e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.729e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.589e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 FAM189B-203ENST00000368366 1962 ntTSL 1 (best)24.55■■□□□ 1.529e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CDKN3-208ENST00000555837 689 ntTSL 224.28■■□□□ 1.489e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.459e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 C3orf58-205ENST00000492452 730 ntTSL 223.96■■□□□ 1.439e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.419e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 KCTD13-201ENST00000308768 1685 ntTSL 223.36■■□□□ 1.339e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 TTBK2-203ENST00000564431 743 ntTSL 322.77■■□□□ 1.249e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.239e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.199e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.199e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.149e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.129e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 TTBK2-204ENST00000566931 520 ntTSL 521.94■■□□□ 1.19e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC23-210ENST00000449039 729 ntTSL 321.75■■□□□ 1.079e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 APPL2-205ENST00000547439 3196 ntTSL 1 (best)21.73■■□□□ 1.079e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.049e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 KCTD13-206ENST00000566842 1860 ntTSL 221.18■□□□□ 0.989e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.889e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.879e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-226ENST00000505322 1859 ntTSL 219.88■□□□□ 0.779e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.779e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.769e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.769e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 FAM189B-209ENST00000497941 871 ntTSL 219.65■□□□□ 0.749e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.79e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 319.35■□□□□ 0.699e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CATSPER2-211ENST00000469461 5071 ntTSL 519.27■□□□□ 0.689e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 AL357673.1-203ENST00000311841 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.15■□□□□ 0.669e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DPP3-204ENST00000526667 832 ntTSL 519.11■□□□□ 0.659e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DDX49-213ENST00000602113 1691 ntTSL 1 (best)18.88■□□□□ 0.619e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.619e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.69e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.589e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.569e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.569e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DDX49-209ENST00000599373 772 ntTSL 318.38■□□□□ 0.539e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 WIPI2-214ENST00000496867 745 ntTSL 518.15■□□□□ 0.59e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-210ENST00000431065 782 ntTSL 418.12■□□□□ 0.499e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 PC-211ENST00000530259 906 ntTSL 517.92■□□□□ 0.469e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 FAM189B-205ENST00000472550 948 ntTSL 517.91■□□□□ 0.469e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.459e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.459e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 RPS6KA4-208ENST00000532885 902 ntTSL 317.67■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.419e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DDX49-210ENST00000599981 583 ntTSL 217.56■□□□□ 0.49e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 ING5-212ENST00000493578 1136 ntTSL 317.19■□□□□ 0.349e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 RPL13P5-205ENST00000451612 587 ntTSL 417.11■□□□□ 0.339e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.29e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.179e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DDX49-204ENST00000595858 1882 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.169e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.159e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.159e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 DDX49-207ENST00000598972 753 ntTSL 315.65■□□□□ 0.19e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 PSMF1-204ENST00000381898 642 ntTSL 315.57■□□□□ 0.089e-13■■■■■ 192.3
UTP3Q9NQZ2 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.069e-13■■■■■ 192.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 851.3 ms