Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ94

A1CF, APOBEC1 complementation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1CFQ9NQ94 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A1CFQ9NQ94 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A1CFQ9NQ94 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms