Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms